Chercheur (H/F) sur l'évaluation des fonctions associées à la séparation de phases chez Nucleocytoviric — CNRS

Missions :

Évaluation des fonctions associées à la séparation de phases chez Nucleocytoviricota

Le laboratoire IGS propose un poste de post-doctorant. Ce poste a pour objectif d'élucider le métabolisme mitochondrial lors de l'infection par les virus géants chez Acanthamoeba castellanii. Le projet sera réalisé en collaboration avec Diamond Light Source, Oxfordshire, Royaume-Uni, et l'Université de Genève, Genève, Suisse. L'objectif final du projet est de parvenir à une dissection fonctionnelle de la fonction mitochondriale lors de l'infection par Nucleocytoviricota

Activités :

Le premier objectif du projet sera d'identifier les protéines associées à la dysfonction mitochondriale lors de l'infection virale. La protéomique, la transcriptomique, l'invalidation génique et l'analyse métabolique seront combinées dans ce but.

Deuxièmement, un marquage au carbone et/ou à l'azote sera réalisé afin de permettre le traçage des flux métaboliques.

Enfin, le post-doctorant s'engagera dans l'exploration de données métagénomiques pour analyser la présence de protéines ciblant les mitochondries au sein du phylum Nucleocytoviricota.

Contexte de travail :

Le laboratoire IGS est pionnier et leader mondial dans l'étude des virus géants dont nous avons découvert les quatre familles connues. Une force unique du laboratoire IGS est la coexistence d'une équipe de biologie computationnelle et d'une équipe de biologie expérimentale, permettant une continuité efficace et transparente depuis l'isolement de nouveaux micro-organismes jusqu'à leur caractérisation complète par la génomique, la transcriptomique, la protéomique et la génétique inverse.

Le laboratoire a également la capacité de déterminer la structure 3D de protéines virales d'intérêt spécifique en utilisant la cristallographie aux rayons X seule ou en combinaison avec la microscopie électronique.

Le laboratoire IGS est déjà bien équipé pour la biologie cellulaire (2 salles L2, 6 PSM, 3 microscopes à fluorescence (dont 1 Zeiss Axio), 4 incubateurs), la biochimie (PCR, 1 PSM Microbiologie, 3 incubateurs, 2 Aktä explorer 10S, 1 Aktä 3D, 1 Aktä Prime, Nanodrop, Qubit, spectrophotomètres 96 puits et 1 mL) et biologie structurale (robot de cristallisation Mosquito, diffractomètre maison (diffraction Oxford Xcalibur PXUltra, un speedvac SPD131 ThermoFischer).

L'IGS a un accès direct aux 12 plateaux techniques de l'Institut Méditerranéen de Microbiologie (IMM, AMU-CNRS FR3479, Effectifs : 300). Les plateformes d'intérêt pour le projet sont l'imagerie fluorescence/TEM (TEM, Cryo-TEM), RMN (600 MHz, cryosonde), Protéomique. , installation d'expression et d'interactions protéiques (1 Aktä prime, 1 Aktä Pure). La plateforme de production de protéines exploite un système Blitz permettant de cribler et de caractériser rapidement les interactions macromoléculaires.

L'IGS dispose également d'un accès permanent aux plateformes d'imagerie du campus de Luminy, dont la microsc

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C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

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