Ingénieur / Ingénieure en Microbiologie H/F — CNRS

Missions :

Nos travaux de recherche portent sur Myxococcus xanthus, une bactérie prédatrice capable de tuer et de lyser ses proies par contact direct. Lors de l’interaction avec une bactérie proie, deux nanomachines essentielles à la prédation sont recrutées et assemblées au niveau du site de contact : le système Kil, homologue à un pilus Tad, et un système de sécrétion de type III atypique, appelé T3SS*, dépourvu d’aiguille (Seef S et al. 2021 eLife, Herrou J et al. 2025 Nat.

Commun.).

L’absence de l’un ou l’autre de ces systèmes entraîne une perte de l’activité prédatrice, indiquant qu’ils jouent un rôle essentiel dans le processus de prédation. Des travaux récents réalisés au sein du laboratoire ont montré que le système Kil est indispensable au recrutement du T3SS*, suggérant l’existence d’un lien fonctionnel étroit entre ces deux nanomachines dans le processus d’intoxication de la proie (Herrou J et al. 2025 Nat. Commun.).

Cependant, les mécanismes moléculaires reliant ces deux systèmes restent à être caractérisés. En particulier, l’identité des effecteurs toxiques impliqués dans la prédation ainsi que les mécanismes permettant leur sécrétion et leur action au niveau de la proie sont inconnus.

Dans ce contexte, les deux objectifs principaux du projet sont :

1. Caractériser, par des approches in silico, in vivo et in vitro, le lien fonctionnel entre les systèmes Kil et T3SS*.

2. Identifier et caractériser les effecteurs moléculaires impliqués dans la prédation de la proie.

Ces travaux permettront de mieux comprendre les mécanismes moléculaires et cellulaires responsables de l’intoxication et de la lyse contact-dépendante des bactéries proies.

Activités :

• Assurer une veille scientifique et technique dans les domaines de la microbiologie, de la biologie cellulaire, de la biologie moléculaire et de la biochimie des protéines
• Participer à la planification et à la conception des expériences, ainsi qu’au suivi des différentes étapes du projet
• Mettre en œuvre des approches de biologie moléculaire : conception d’amorces, PCR, clonage, construction de plasmides et remplacement allélique
• Générer des mutants de M. xanthus afin de caractériser la fonction et l’importance de protéines candidates du système Kil et du T3SS* au cours de la prédation
• Produire et purifier des protéines recombinantes en système procaryote (E. coli) afin d’étudier les interactions protéine-protéine entre les composants des systèmes Kil et T3SS*, et de caractériser l’activité de potentiels effecteurs toxiques
• Mettre en place et réaliser des expériences de microscopie à fluorescence afin de suivre, au cours de la prédation, le recrutement et la dynamique de protéines du Kil et du T3SS* au niveau du site de contact avec la proie
• Mettre en place et réaliser des tests phénotypiques permettant d’évaluer l’efficacité de prédation de différents mutants de M. xanthus
• Analyser, interpréter et documenter les

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Competences :

• Solides compétences en microbiologie et en production et purification de protéines recombinantes
• Expérience en biologie moléculaire : conception d’amorces, PCR, clonage, construction de plasmides et, idéalement, remplacement allélique chez les bactéries
• Expérience en microscopie à fluorescence et des connaissances en analyse d’images et en traitement de données quantitatives seraient un plus
• Des connaissances en caractérisation biochimique et/ou en étude des interactions protéine-protéine seraient particulièrement appréciées

savoirs être :

• Rigueur scientifique et sens critique
• Esprit d’initiative et capacité à s’adapter à l’évolution des stratégies expérimentales
• Curiosité, créativité et goût pour l’exploration de nouvelles approches expérimentales
• Bonnes capacités d’analyse, d’interprétation et de synthèse des résultats
• Capacité à travailler de manière autonome tout en s’intégrant dans un environnement de recherche collaboratif
• Sens de l’organisation et capacité à planifier les expériences et à respecter les échéances
• Bonnes capacités de communication orale et écrite en français et/ou anglais

Contraintes et risques :

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international.

Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.

Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

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