Ingénieur d'étude en Biologie (H/F) — CNRS

Missions :

L’ingénieur(e) d’études participera à un projet de recherche international et interdisciplinaire visant à caractériser les capacités d’apprentissage et de mémoire chez les organismes unicellulaires, en utilisant le cilié Spirostomum ambiguum comme modèle expérimental.

Sa mission principale consistera à concevoir, développer et mettre en œuvre des protocoles expérimentaux permettant de caractériser rigoureusement différentes formes d’apprentissage, notamment l’habituation, la sensibilisation et l’apprentissage associatif.

La personne recrutée sera également chargée du développement d’outils de suivi automatisé du comportement, de l’analyse quantitative des données expérimentales et du maintien des cultures biologiques dans des conditions parfaitement contrôlées.

Activités :

Assurer l’élevage, l’entretien et le suivi des cultures de ciliés (Spirostomum ambiguum) dans des conditions environnementales standardisées.

Concevoir, mettre au point et réaliser des expériences comportementales destinées à étudier les capacités d’apprentissage et de mémoire des ciliés.

Développer et optimiser des dispositifs expérimentaux permettant l’application contrôlée de différents stimuli (mécaniques, lumineux, électriques, etc.).

Mettre en œuvre des protocoles d’habituation, de sensibilisation et de conditionnement associatif, en intégrant les contrôles expérimentaux nécessaires pour distinguer l’apprentissage d'autres phénomènes physiologiques.

Développer et améliorer des systèmes automatisés d’acquisition vidéo et de suivi du comportement (tracking).

Concevoir et programmer en Python des outils d’analyse d’images, de détection et de quantification des réponses comportementales, notamment des contractions cellulaires.

Assurer le traitement, l’analyse statistique et la visualisation des données expérimentales.

Participer à la conception des expériences, à l’interprétation des résultats et à la rédaction de rapports scientifiques.

Présenter régulièrement les résultats lors de réunions avec les partenaires internationaux du projet, en anglais.

Participer à la gestion des données, à la documentation des protocoles et à la reproductibilité des expériences.

Contexte de travail :

La personne recrutée intégrera une équipe de recherche du CNRS au sein du Centre de Biologie Intégrative à Toulouse, spécialisée dans l’étude du comportement, de l’apprentissage et de la cognition chez les organismes dépourvus de système nerveux.

Elle participera à un projet collaboratif international financé dans le cadre du programme Human Frontier Science Program (HFSP), réunissant des équipes aux expertises complémentaires en biologie comportementale, biophysique et biologie cellulaire.

L’activité sera principalement expérimentale, associant élevage d’organismes vivants, mise au point de dispositifs expérimentaux, acquisition vidéo, programmation informatique et analyse quantitative des comportements.

La personne recrutée travail

Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...

Competences :

Formation en biologie, éthologie, neurosciences, biophysique ou dans une discipline scientifique apparentée (niveau master).

Excellente maîtrise de la programmation en Python, notamment pour le traitement et l’analyse de données expérimentales.

Expérience en analyse d’images et de vidéos, en suivi automatisé d’organismes (tracking) et en quantification du comportement.

Bonne maîtrise des méthodes d’analyse statistique et de représentation graphique des données.

Expérience dans l’élevage et le maintien d’organismes vivants en conditions expérimentales contrôlées.

Capacité à concevoir et conduire des expériences rigoureuses, avec des contrôles adaptés et une attention particulière à la reproductibilité.

Maîtrise parfaite de l’anglais, à l’oral comme à l’écrit (niveau bilingue indispensable), compte tenu des interactions fréquentes avec les partenaires internationaux.

Connaissances en éthologie expérimentale, apprentissage et mémoire.

Expérience dans l'étude du comportement d'organismes unicellulaires ou de petits organismes aquatiques.

Maîtrise de bibliothèques Python dédiées au traitement de données et à la vision par ordinateur (NumPy, pandas, OpenCV, scikit-image, etc.).

Connaissance des techniques de microscopie optique et d’acquisition vidéo.

Expérience dans le développement ou l’adaptation de dispositifs expérimentaux automatisés.

Contraintes et risques :

Travail expérimental sur organismes vivants nécessitant un suivi régulier des cultures et le maintien de conditions environnementales stables.

Nécessité de respecter des protocoles expérimentaux standardisés et de garantir la reproductibilité des mesures.

Possibilité d’adaptation ponctuelle des horaires en fonction des contraintes liées à l’entretien des cultures et à la durée des expériences comportementales.

Travail prolongé sur ordinateur pour la programmation, le traitement vidéo et l’analyse des données.

Utilisation d’équipements de laboratoire, de dispositifs de stimulation et de systèmes de microscopie nécessitant le respect des règles habituelles de sécurité.

Manipulation de milieux de culture et de produits de laboratoire dans le respect des procédures de prévention applicables.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international.

Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.

Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

En savoir plus sur l'employeur