Ingénieur d’études en techniques biologiques H/F - production et caractérisation de glycoprotéines et d — CNRS

Missions :

Dans le cadre du projet ANR Chick-MUG (« Chicken Host Interactions with Salmonella, secreted Mucin, and Glycosylation »), la personne recrutée assurera principalement la préparation, la production, la purification et la caractérisation de glycoprotéines et d’oligosaccharides, notamment issus des mucines intestinales du poulet, afin d’étudier leurs interactions avec Salmonella Enteritidis.

Activités :

• Préparer, produire lorsque cela est adapté, extraire et purifier des glycoprotéines, en particulier des mucines, à partir de matériels biologiques
• Libérer, isoler, purifier et caractériser des oligosaccharides, notamment les O-glycanes de mucines ; comparer les profils de glycosylation (fucosylation, sialylation et sulfatation)
• Mettre en œuvre et optimiser les analyses par spectrométrie de masse, notamment MALDI, et les séparations chromatographiques nécessaires à la caractérisation des glycoprotéines et oligosaccharides
• Préparer des glycoprotéines, oligosaccharides et échantillons analytiques pour les études d’interactions avec des protéines bactériennes et pour les analyses réalisées avec les partenaires du projet
• Développer et documenter des protocoles de production, extraction, purification et contrôle qualité des glycoprotéines ; mettre en œuvre la libération, la purification et la préparation des oligosaccharides pour les analyses structurales
• Réaliser les analyses chromatographiques (notamment HPLC) et de spectrométrie de masse (notamment MALDI-TOF et, selon les équipements disponibles, MS/MS) ; traiter, comparer et interpréter les profils analytiques
• Exploiter et interpréter les résultats expérimentaux, assurer leur traçabilité, préparer figures, comptes rendus, protocoles et présentations scientifiques
• Coordonner les échanges d’échantillons et de résultats avec les partenaires du consortium et participer aux réunions du projet
• Gérer les consommables et réactifs nécessaires aux expériences ; appliquer les procédures qualité, d’hygiène, de sécurité et de biosécurité du laboratoire

Contexte de travail :

Le poste est basé à l’UGSF (UMR 8576 CNRS / Université de Lille), au sein de l’équipe partenaire 1 du projet Chick-MUG, sous la responsabilité scientifique de Yannick Rossez. Le consortium associe l’UGSF, l’UMR ISP 1282 (INRAE / Université de Tours), la Plateforme d’Infectiologie Expérimentale (INRAE) et Hendrix Genetics. Les travaux de l’UGSF portent notamment sur la glycomique structurale, les adhésines de Salmonella et les interactions entre glycanes et bactéries.

Les analyses pourront mobiliser les équipements et plateformes accessibles à l’équipe, notamment PAGES et les infrastructures de spectrométrie de masse et de RMN. Des déplacements professionnels ponctuels à l’étranger, pouvant durer quelques semaines, sont à prévoir pour réaliser des analyses spécialisées nécessaires au projet. Leur calendrier et leur destination seront définis selon les b

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Competences :

• Expérience pratique en production, extraction et purification de glycoprotéines et autres glycoconjugués ; maîtrise des techniques de biochimie des protéines, des méthodes de fractionnement et du contrôle qualité (électrophorèse, dosages, chromatographie)
• Expérience en préparation, libération et purification d’oligosaccharides,

notamment de glycanes associés aux mucines ; connaissances en glycosylation et en caractérisation de structures glucidiques.

• Maîtrise ou bonne pratique de la chromatographie (HPLC, éventuellement GC) et de la spectrométrie de masse (en particulier MALDI-TOF, idéalement MS/MS) pour l’analyse de glycoprotéines et d’oligosaccharides ; aptitude à interpréter les données et à assurer leur traçabilité
• Rigueur, autonomie, sens de l’organisation, aptitude au travail en équipe et à la collaboration interdisciplinaire
• Capacité à rédiger des protocoles et rapports ; anglais scientifique permettant la lecture et la communication technique

Expérience souhaitée : au moins 3 ans d’expérience professionnelle en biochimie des glycoconjugués, production et purification de glycoprotéines ou d’oligosaccharides, chromatographie et/ou spectrométrie de masse. Une expérience plus importante sera également appréciée.

Contraintes et risques :

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international.

Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.

Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

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