Ingénieur.e de recherche en chémobiologie et biophysique - CDD de projet 1 an — Université de Strasbourg

CDD de projet 1 an

Démarrage à compter du 01/02/2027

Catégorie : A Corps : Ingénieur de recherche

Emploi ouvert aux agents contractuels uniquement

Rémunération selon grille de la Fonction Publique

Affectation : Laboratoire d’Innovation Thérapeutique (LIT – UMR CNRS 7200)

Mission

Projet de recherche :

Les peptides antimicrobiens lytiques représentent une alternative prometteuse aux antibiotiques classiques, car ils ciblent les membranes cellulaires des pathogènes, réduisant ainsi le risque de résistance bactérienne. Leur développement comme agents thérapeutiques nécessite cependant une compréhension fine de leur mode d’action moléculaire, encore partiellement élucidé.

Pour répondre à ce défi, nous visons à proposer une approche innovante combinant fluorescence sensible à l’environnement et cytométrie en flux. Cette méthodologie permettra d’analyser en temps réel les interactions entre les peptides et les membranes bactériennes, en exploitant la sensibilité des fluorophores aux variations locales de l’environnement.

À l’interface entre chémobiologie, biophysique et microbiologie, ce projet contribuera à élucider les mécanismes moléculaires précis gouvernant l’action des peptides antimicrobiens, tout en développant des outils analytiques innovants pour accélérer leur optimisation en tant qu’agents thérapeutiques durables.

Activités

• Caractérisation photophysique des sondes fluorescentes développées au laboratoire
• Évaluation de la capacité des sondes fluorescentes à marquer les bactéries modèles et les isolats cliniques par microscopie de fluorescence et cytométrie en flux
• Développement d’une approche pour étudier les mécanismes d’action lytique des peptides antimicrobiens
• Mise au point d’une approche d’analyse des bactéries par microfluidique

Activités associées

• Participation aux réunions scientifiques du projet et du laboratoire
• Contribution à la gestion et à l’organisation des données expérimentales dans une démarche de science ouverte
• Participation à l’encadrement des étudiants en M1 et en BUT
• Présentation des résultats lors de congrès nationaux et internationaux
• Participation à la rédaction de publications scientifiques

Candidater

Connaissances :

• Doctorat en biophysique, physique ou biologie
• Connaissances en photophysique, notamment en spectroscopie et en microscopie de fluorescence
• Des connaissances dans le domaine des peptides antimicrobiens sont très souhaitables

Compétences opérationnelles :

• Solide expérience en spectroscopie et en microscopie de fluorescence
• Expérience du traitement d’images et de données de spectroscopie (ImageJ/Fiji, OriginLab)
• Expérience en culture bactérienne
• Capacité à analyser, interpréter et valoriser des résultats scientifiques
• Expérience en rédaction scientifique et en publication dans des revues internationales
• Expérience en encadrement (stagiaires, doctorants)

Compétences comportementales :

• Autonomie et sens de l'organisation
• Rigueur scientifique et esprit critique
• Curiosité intellectuelle et capacité à travailler à l'interface de plusieurs disciplines
• Aptitude au travail en équipe et aux collaborations interdisciplinaires
• Bonnes capacités de communication écrite et orale en anglais

Le projet sera réalisé au sein du Laboratoire d’Innovation Thérapeutique (LIT, UMR CNRS 7200), unité mixte de recherche associant le CNRS et l’Université de Strasbourg et dirigée par le Dr Didier Rognan. Le LIT, structuré en trois équipes, regroupe environ 60 chercheurs et personnels d’appui autour d’un objectif commun : la conception, la synthèse, la caractérisation et l’identification de molécules bioactives pour mieux comprendre le vivant et développer de nouvelles stratégies thérapeutiques.

Le projet sera réalisé au sein de l’équipe « Chémobiologie et Pharmacognosie pour la Santé » (CPS), dirigée par le Dr. Dominique Bonnet, qui a pour objectif de découvrir des molécules originales permettant de comprendre le Vivant et de le « manipuler » dans une perspective cognitive ou thérapeutique.

Le/la chercheur(euse) recruté(e) bénéficiera d’un environnement scientifique multidisciplinaire ainsi que de l’accès aux plateformes de spectroscopie de fluorescence (SPPS), de microscopie de fluorescence (PIQ-Quest) et de cytométrie en flux (PACSI) de l’Université de Strasbourg.