Ingénieur (H/F) en techniques biologiques — CNRS

Missions :

Préparer et optimiser les bibliothèques d’ADN et d’ARN issues de carottes de glace en vue de leur séquençage, dans un contexte de faible biomasse.

Activités :

Préparation des échantillons :

Extraire et purifier l’ADN et ARN à partir de carottes de glace, en respectant des protocoles adaptés aux échantillons à faible biomasse.

Optimiser les méthodes de concentration et de purification pour maximiser la récupération d’ADN et d’ARN.

Construction des bibliothèques :

Appliquer des techniques de PCR, clonage et génotypage pour préparer les échantillons avant séquençage.

Utiliser des méthodes de séquençage haut débit (ex : Illumina, Nanopore) et adapter les protocoles en fonction des spécificités des échantillons glaciaires.

Contrôle qualité :

Réaliser des analyses par électrophorèse, cytométrie et microscopie pour évaluer la qualité et la quantité d’ADN et d’ARN.

Valider les bibliothèques avant séquençage (ex : vérification de la taille des fragments, absence de contaminants).

Collaboration et documentation :

Travailler en étroite collaboration avec les chercheurs de l’équipe ICE3 pour ajuster les protocoles.

Documenter les procédures et les résultats dans un cahier de laboratoire ou un système de gestion des données.

Contexte de travail :

L’Institut des Géosciences de l’Environnement IGE est une unité mixte de recherche multitutelles (CNRS, INRAE, IRD, UGA, Grenoble INP) hébergée sur le campus de St Martin d’Hères près de Grenoble et faisant partie de l’Observatoire des Sciences de l’Univers de Grenoble (OSUG).

L’IGE étudie les climats, le fonctionnement de la planète et de ses évolutions en termes de pollutions, de changements globaux et de risques pour les sociétés. Historiquement, l’IGE conduit ses recherches dans des régions aux enjeux sociétaux et environnementaux prégnants : les régions polaires, la zone intertropicale, et les régions de montagne.

L’effectif moyen du laboratoire est d’environ 330 personnes, dont 190 membres permanents (chercheurs·es, enseignant·es-chercheurs·es, ingénieur·es, technicien·nes et personnels administratifs) et environ 140 doctorant·es, post-doctorant·es et personnels en contrat à durée déterminée. Le laboratoire accueille chaque année une centaine de stagiaires et visiteurs·euses scientifiques. L’IGE est hébergé dans quatre bâtiments situés sur le campus universitaire de Grenoble (bâtiment Glaciologie, OSUG-B, Maison Climat Planète et INRAE-Grenoble Saint Martin d’Hères)

La personne recrutée intégrera l’équipe ICE3, sous la responsabilité de Catherine Larose, pour soutenir le projet Paleo-MARE.

Competences :

 Savoirs / connaissances

Maîtrise des techniques de biologie moléculaire : extraction d’ADN, d’ARN, PCR, électrophorèse, séquençage.

Connaissance des enjeux liés à la faible biomasse (ex : contamination, sensibilité des méthodes).

Familiarité avec les outils bioinformatiques de base pour l’analyse des données de séquençage (un plus).

 Savoir-faire

Expérience en manipulation d’échantillons environnementaux (idéalement glace ou milieux extrêmes).

Capacité à optimiser des protocoles pour des échantillons complexes.

Utilisation d’équipements de laboratoire : thermocycleurs, systèmes de séquençage, microscopes.

 Savoirs-être

Rigueur et minutie (travail en environnement stérile, éviter les contaminations).

Autonomie et capacité d’adaptation (travail sur des protocoles en évolution).

Esprit d’équipe et communication claire (collaboration avec chercheurs et techniciens).

Contraintes et risques :

RAS

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international.

Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.

C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.

Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.

Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

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