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Thèse : Interactions microbiote-hôte associées aux émissions de méthane et à l'efficience alimentaire — INRAE Centre Clermont - Auvergne-Rhône-Alpes

Saint-Genès-Champanelle · Toutes les offres de cet employeur

Jusqu'au 02/12 · encore 17 joursCatégorie A

En bref

Thèse : Interactions microbiote-hôte associées aux émissions de méthane et à l'efficience alimentaire — INRAE Centre Clermont - Auvergne-Rhône-Alpes, à Saint-Genès-Champanelle (Puy-de-Dôme). Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels, Fonction publique de l'État. Catégorie A. Poste ouvert aux contractuels. Candidatures jusqu'au 02/12/2026.

Détails

Type	Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
Employeur	INRAE Centre Clermont - Auvergne-Rhône-Alpes Enseignement supérieur et recherche
Fonction publique	Fonction publique de l'État
Poste	Thèse : Interactions microbiote-hôte associées aux émissions de méthane et à l'efficience alimentaire
Catégorie	A
Métier(s)	Chercheuse / Chercheur
Famille de métiers	Recherche
Lieu de travail	Saint-Genès-Champanelle (Puy-de-Dôme) 63122 Saint-Genès-Champanelle
Statut	Fonctionnaires et contractuels
Ouvert aux contractuels	Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
Télétravail	Non renseigné
Poste à pourvoir le	01/04/2027
Rémunération	Non indiquée dans l'offre. Pour un fonctionnaire, la rémunération dépend du grade et de l'échelon (grille indiciaire), plus les primes de l'employeur.
Publiée le	03/11/2026
Date limite de candidature	02/12/2026 — encore 17 jours
Référence	2026-2459855
Source	Choisir le service public

Les missions

L’objectif de cette thèse est de définir comment les variations de composition et d’activité du microbiote ruminal, induites par l’ajout de suppléments anti-méthane dans les rations alimentaires, modulent l’équilibre dynamique entre émissions de méthane et efficience alimentaire chez les bovins.

Cette thèse s’appuie sur trois expérimentations qui ont été réalisées dans le cadre du projet Methane2030 :

une première expérimentation conduite sur 48 vaches laitières supplémentées avec deux suppléments anti-méthane complémentaires, cinq échantillonnages couplés de jus de rumen et de sang ont été réalisés au total, sur l’ensemble des vaches au cours de cet essai ;

une deuxième expérimentation conduite sur 40 jeunes bovins en engraissement supplémentés avec un supplément anti-méthane, trois échantillonnages couplés de jus de rumen et de sang ont été réalisés au total, sur l’ensemble des jeunes bovins au cours de cet essai ;

une troisième expérimentation conduite sur 48 génisses supplémentées dès la naissance avec un supplément anti-méthane, cinq échantillonnages couplés de jus de rumen et de sang ont été réalisés au total, sur l’ensemble des veaux au cours de cet essai.

Votre mission consistera à étudier les modifications du microbiote ruminal induites par l'utilisation de suppléments anti-méthane et à rechercher leurs associations avec le métabolisme et l'efficience alimentaire des animaux, chez des vaches laitières et des bovins en croissance.

Vous vous attacherez plus particulièrement à montrer l’évolution de la composition et des fonctions des méthanogènes ainsi que des populations bactériennes impliquées dans la dégradation des protéines, avant, pendant et après l’utilisation de suppléments anti-méthane.

Ainsi, vous serez plus particulièrement en charge de :

rédiger une synthèse bibliographique sur les liens entre métabolisme du microbiote ruminal et métabolisme de l’hôte dans le contexte général précédemment exposé afin de structurer votre question scientifique de thèse ;

définir une stratégie de sélection des échantillons à analyser à partir des données physiologiques disponibles, en fonction des hypothèses retenues ;

produire et analyser les données omiques du microbiote ruminal et les données métaboliques de l’hôte puis les intégrer aux données physiologiques afin d’identifier les mécanismes potentiellement associés aux réponses à la supplémentation avec des suppléments anti-méthane ;

valoriser l’exploitation des données par des publications scientifiques et des communications orales en congrès scientifique.

Profil recherché

Diplôme minimum requis : Bac+5.

Formation recommandée : Bac+5 en microbiologie, analyses biochimiques ou biologie moléculaire.

Connaissances souhaitées : Fonctionnement de l’écosystème ruminal dans la nutrition de l’hôte, compétences d’analyses de données omiques, compétences de laboratoire pour la préparation d’échantillons.

Expérience appréciée : Une première expérience en laboratoire de recherche serait appréciée.

Aptitudes recherchées : Capacité de coopération en équipe multidisciplinaire, appétence pour la recherche, capacité de synthèse, capacités rédactionnelles.

Niveau d'études demandé

Niveau 7 Master/diplômes équivalents

Informations complémentaires

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :

jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle
de la prise en charge à 50 % de votre cotisation à la complémentaire santé collective
d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs
d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux
de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel
d'activités sportives et culturelles
d'une restauration collective

Le site de Theix, situé à Saint-Genès-Champanelle, est desservi par la ligne de bus P39 de la T2C ainsi que par une ligne de transport à la demande ; il est également équipé d'un parking et de services dédiés au vélo.

L'employeur se présente

INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Le service

Vous exercerez votre activité au sein de l'Unité Mixte de Recherche sur les Herbivores (UMRH). Cette Unité a pour mission de produire, intégrer et diffuser des connaissances, et partager l’expertise pour concevoir des systèmes d’élevage herbivores multi-performants répondant aux enjeux des changements globaux (environnementaux, socio-économiques et transition numérique). L'Unité compte 118 personnes titulaires et accueille chaque année 70 personnes non-permanentes.

Elle est organisée en 4 équipes de recherche, une équipe de Direction et une équipe d’appui. Vous travaillerez au sein de l'équipe DINAMIC (Digestion, Nutrition, Absorption et Microbes) qui mène des recherches sur la digestion microbienne des aliments pour animaux et l'absorption des nutriments, un maillon essentiel de la recherche en alimentation et nutrition animales.

Documents pour la candidature

L'offre ne les détaille pas toujours : voici les pièces habituelles. Confirmez la liste exacte auprès de l'employeur.

CV à jour
Lettre de motivation adressée à l'employeur
Fonctionnaires : votre dernier arrêté de situation administrative
Contractuels : la copie des diplômes ou titres demandés pour le poste
Le cas échéant, le justificatif de reconnaissance de la qualité de travailleur handicapé (RQTH)

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Source : Choisir le service public, offre 2026-2459855 publiée le 03/11/2026. Données structurées par Emploi Mairie à partir de l'offre ; l'information officielle est celle de l'offre publiée par l'employeur.

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