Ingénieur-e en bioinformatique et neurosciences — Inserm

Dans le cadre des activités de recherche de l’équipe de Homaira NAWABI « Du développement à la réparation» de l'unité de rechercche Grenoble Instititut Neurosciences, le/la bioinformaticien(ne) participera à un projet visant à analyser et intégrer des données biologiques à haut débit (single nuclei RNA seq ; analyses haut débits déjà publiés, données de protéomique) pour mieux comprendre les mécanismes biologiques mis en jeu lors de la formation de circuits neuronaux

Activités principales :

Analyse de données biologiques : traitement, nettoyage et normalisation de données issues de cytométrie en flux et de plateformes protéomiques

Intégration multi-omique : mise en oeuvre d’approches d’intégration de données hétérogènes (biologiques et cliniques).

Analyse statistique et modélisation : analyses exploratoires, analyses multivariées,clustering, réduction de dimension, identification de signatures biologiques et découverte de biomarqueurs.

Développement de pipelines reproductibles : création et maintenance de workflows d’analyse sous R/Python

Interaction avec l’équipe : échanges réguliers avec biologistes, participation aux réunions de projet.

Rédaction et communication scientifique : préparation de figures, rapports, documentation, contributions aux publications.

Gestion des données : organisation, documentation et archivage des données selon les bonnes pratiques (FAIR, traçabilité).

Formation

Diplôme de niveau Bac+5

Connaissances

Maîtrise des concepts et méthodes en bioinformatique, biostatistiques et analyse de données omiques.

Solides compétences en R et/ou Python (ou autre langage de programmation adapté à l'analyse de données).

Expertise en transcriptomique et/ou protéomique, avec une bonne connaissance des deux domaines appréciée.

Connaissance des approches et méthodes d'intégration de données multi-omiques.

Bonne compréhension des principes de la biologie des systèmes ; des connaissances en neurosciences seraient un atout.

Maîtrise des principes FAIR et des bonnes pratiques de gestion et de valorisation des données scientifiques.

Compétences techniques

Analyser et interpréter des jeux de données biologiques complexes et volumineux.

Développer, automatiser et documenter des pipelines d'analyse reproductibles.

Mettre en œuvre des méthodes statistiques avancées adaptées aux données omiques.

Produire des visualisations pertinentes et communiquer efficacement des résultats complexes.

Rédiger des protocoles, rapports d'analyse, documentations techniques et publications scientifiques.

Qualités attendues

Rigueur scientifique et sens de la qualité.

Esprit d'analyse et de synthèse.

Autonomie et capacité à piloter des projets d'analyse de données.

Aptitude à travailler au sein d'équipes pluridisciplinaires associant biologistes, cliniciens et data scientists.

Excellentes qualités relationnelles et de communication, à l'écrit comme à l'oral.

Sens de l'organisation, gestion des priorités et capacité d'adaptation.

Force de proposition et aptitude à anticiper et résoudre les problématiques techniques ou scientifiques.

Expérience souhaitée

Expérience significative en analyse de données omiques (transcriptomique, protéomique, cytométrie, etc.).

Expérience en intégration multi-omique ou en data science appliquée aux sciences biomédicales.

Expérience du travail dans un environnement de recherche académique ou en collaboration avec des équipes biologiques et/ou cliniques.

Une expérience dans le domaine des neurosciences

La science pour la santé

L’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biomédicale. Nous portons un engagement : améliorer la santé de toutes et tous en faisant progresser les connaissances sur le vivant et sur les maladies.

Depuis la création de l’Institut, ses personnels ont participé au dépôt de plus de 2 700 familles de brevets, ainsi qu’à des avancées en santé décisives : la première fécondation in vitro, l’identification du VIH, la première greffe de peau, la thérapie génique, le Nutriscore…

Pour mener sa mission de service public, l’Inserm réunit des scientifiques de toutes disciplines, ainsi que des professionnels de santé, mais aussi des juristes, des informaticiens, des gestionnaires financiers…

À nos côtés, vous participerez à l’innovation pour la santé de tous, dans tous les domaines de la recherche biomédicale : neurosciences, maladies infectieuses, cancer, maladies métaboliques et cardiovasculaires, santé publique, santé mentale, technologies pour la santé, génétique, immunologie, inflammation et hématologie.

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